(E) Excellent research from UCSF, Institut Pasteur, Gladstone Institutes, and Icahn School of Medicine at Mount Sinai to find the right antiviral drugs for Covid-19: “A SARS-CoV-2 protein interaction map reveals targets for drug repurposing“. This is so far, the most promising research study to explore the best possible treatments for Covid-19, that I read (but please consider that I am not a biologist):

(Shorten) Abstract:

“There are currently no antiviral drugs with proven clinical efficacy, nor are there vaccines for its prevention, and these efforts are hampered by limited knowledge of the molecular details of SARS-CoV-2 infection. To address this, we cloned, tagged, and expressed 26 of the 29 SARS-CoV-2 proteins in human cells and identified the human proteins physically associated with each using affinity-purification mass spectrometry (AP-MS), identifying 332 high-confidence SARS-CoV-2-human protein-protein interactions (PPIs). Among these, we identify 66 druggable human proteins or host factors targeted by 69 compounds (29 FDA-approved drugs, 12 drugs in clinical trials, and 28 preclinical compounds). Screening a subset of these in multiple viral assays identified two sets of pharmacological agents that displayed antiviral activity: inhibitors of mRNA translation and predicted regulators of the Sigma1 and Sigma2 receptors. Further studies of these host factor targeting agents, including their combination with drugs that directly target viral enzymes, could lead to a therapeutic regimen to treat COVID-19.”

A key summary from Institut Pasteur’s decription “COMMENT L’ÉTUDE DES MÉCANISMES DE MULTIPLICATION DU SARS-COV-2 PERMET D’IDENTIFIER DES MOLÉCULES POTENTIELLEMENT ANTIVIRALES” about this paper:

“Les chercheurs (de cette étude) se sont appuyés sur une liste de médicaments qui interagissent avec les protéines identifiées pour mener des études à l’aide de la chimie biologique et d’approches computationnelles. Ces études ont fait apparaître deux catégories de médicaments se révélant comme des agents prometteurs dans la réduction efficace de l’infectiosité du virus SARS-CoV-2 : d’une part les inhibiteurs de la traduction des protéines (dont la zotatifine et la ternatine-4/plitidepsine) et d’autre part des médicaments qui modulent des protéines intracelllulaires, appelées récepteurs Sigma-1 et Sigma-2 : progestérone, PB28, PD-144418, hydroxychloroquine ou encore les antipsychotiques halopéridol et clopérazine, la siramésine, un antidépresseur et anxiolytique, ainsi que les antihistaminiques clémastine et clopérastine. 

Parmi les inhibiteurs de la traduction des protéines, l’effet antiviral le plus important a été observé in vitro avec la zotatitfine, actuellement en essais cliniques contre le cancer, et la ternatine-4/plitidepsine, approuvée par la FDA dans le traitement du myélome multiple.

Dans la catégorie des modulateurs Sigma-1 et Sigma-2, l’antipsychotique halopéridol, administré dans le traitement de la schizophrénie, a montré une activité antivirale contre le SARS-CoV-2, contrairement à l’olanzapine, indiquée en cas de schizophrénie et de trouble bipolaire, dont l’effet mesurable sur le virus s’est avéré nul. Deux puissants antihistaminiques, la clémastine et la clopérastine, ont révélé une activité antivirale, à l’instar du PB28, et, dans une moindre mesure, de l’hormone féminine progestérone.”

Note: The picture above is from Wassily Kadinsky “through-going line”.

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